Beim Aufwachen steigt die Körpertemperatur wieder an. Der Körper setzt diesen Temperaturanstieg selbst in Gang; die biologische Uhr schaltet gewissermaßen das Heizsystem ein. Parallel zum Temperaturanstieg sinkt das Niveau des Schlafhormons Melatonin, während der Cortisolpegel ansteigt. Cortisol ist eine Substanz, die in gewisser Hinsicht mit Adrenalin vergleichbar ist; es hat die Aufgabe, sozusagen den Motor des Körpers in Gang zu setzen. Im Laufe des Vormittags sinkt der Cortisolpegel wieder ab.